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自适应Lambda调度——一种提高自由能微扰模拟计算效率的方法
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3D-QSAR与Spark生物等排体替换联合使用——高效骨架跃迁设计新型FABP4抑制剂
25.01.11
药物化学设计的核心问题——Forge和Spark之间的协同关系
25.01.11
用Activity Atlas解决选择性问题
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警惕虚拟筛选性能测试的结论——选择合理的蛋白结构来提高富集性能
本文以DUD-E的靶标HIV PR为例,演示了蛋白结构选择对虚拟筛选性能的影响。 ...
Flare™系综共价对接
系综共价对接(Ensemble Covalent Docking)是Flare最近引入的一个新功能。 ...
Flare™V7.0发布——增强的分子对接、更好的QSAR建模与更精确的FEP与MD结果
Flare是Cresset基于配体和基于结构的建模平台,本文介绍了最新版本V7全新的、增强的科学和方法,包括用大正则非平 ...
用分子动力学模拟生成蛋白构象系综以用于生物学更加合理的分子对接实验
在本月初的网络研讨会上,我们展示了Flare中的分子动力学模拟和对接如何作为一种先进的研究技术而协同工作。 ...
用Pyflare来简化苗头化合物的识别
Pyflare是一个专用的python二进制文件,可以从命令行python脚本中访问Flare的全部功能。 ...
用分子动力学模拟生成蛋白构象系综用于对接实验更具生物学合理性
对接是一种利用蛋白结构产生配体结合模式(pose)并对所产生的相互作用进行打分的方法。 ...
OEDocking——信息用的越多,虚拟筛选性能越好
本文用DUDE+数据集对OEDocking使用单一apo结构的FRED分子对接、单一holo结构的HYBRID分子对接( ...
关于分子对接预测结合模式的问题
本文以Imatinib、dasatinib与ABL1激酶复合物结合模式为例,解释为什么分子对接并不是一件容易的事。 ...
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