ensemble docking Archives - 墨灵格的博客

警惕虚拟筛选性能测试的结论

本文以DUD-E的靶标HIV PR为例，演示了蛋白结构选择对虚拟筛选性能测试的影响。具体的讲，当使用PDB 1XL2作为…

系综共价对接（Ensemble Covalent Docking）是Flare最近引入的一个新功能。本文以脯氨酰寡肽酶（…

Flare是Cresset基于配体和基于结构的建模平台，本文介绍了最新版本V7全新的、增强的科学和方法，包括用大正则非平…

在本月初的网络研讨会上，我们展示了Flare中的分子动力学模拟和对接如何作为一种先进的研究技术而协同工作。在传统的对接模…

Pyflare是一个专用的python二进制文件，可以从命令行python脚本中访问Flare的全部功能。这使得诸如对接…

对接是一种利用蛋白结构产生配体结合模式(pose)并对所产生的相互作用进行打分的方法。在药物发现中，该方法广泛用于筛选分…

本文用DUDE+数据集对OEDocking使用单一apo结构的FRED分子对接、单一holo结构的HYBRID分子对接（…

本文以Imatinib、dasatinib与ABL1激酶复合物结合模式为例，解释为什么分子对接并不是一件容易的事。