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Flare V9先睹为快——前沿的科学、集成和可用性
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文章标签 "OEDocking"
ORION云计算——OEDocking与ROCS超高通量虚拟筛选计算服务
ORION是OpenEye基于AWS的云计算计算,部署了OpenEye的全部软件工具并整合多种开源软件。ORION以专有…
小墨
discovery service
2022-04-18
2,003
0
OEDocking——信息用的越多,虚拟筛选性能越好
本文用DUDE+数据集对OEDocking使用单一apo结构的FRED分子对接、单一holo结构的HYBRID分子对接(…
小墨
Benchmarking
2022-04-11
2,612
0
用多个蛋白信息来提高用单一蛋白结构分子对接虚拟筛选的性能
本文以PDE5A数据集为例,比较了使用单一apo结构的FRED分子对接虚拟筛选与使用多个holo结构的HYBRID分子对…
小墨
Benchmarking
2022-03-02
2,875
1
基于药效团、分子对接、分子形状的深度增强学习结构生成案例汇总
深度生成模型已用来进行从头分子设计,能够生成性质理想的化合物。然而,大部分深度生成模型的性质并不包含比如形状、药效团以及…
原创文章
小墨
案例
2021-07-21
3,098
0
用常规分子对接进行共价抑制剂的虚拟筛选
本文演示了如何用受体立体碰撞消除(SCAR)法进行共价抑制剂的分子对接虚拟筛选:将常规分子对接虚拟筛选与Ligandsc…
原创文章
小墨
Cresset
2020-03-22
8,873
3
OpenEye案例 | 用FreeForm改善MM/PBSA计算结合自由能
在本研究中,作者用MM/PBSA方法预测配体的EcR结合活性。首先 使用40个已知EcR配体的验证研究表明,当引入配体的…
原创文章
小墨
OpenEye
2019-06-05
4,965
0
分子对接教程–用FRED进行虚拟筛选
FRED是OpenEye OEDocking软件包的一个分子对接程序,它将化合物数据库对接到一个受体口袋里进行结合模式预…
小墨
Docking
2016-09-15
8,148
1
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克服药物发现与开发的关键挑战——用AI技术预测ADMET
蛋白质动力学和药物发现——通过主成分分析提升项目开发
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超大化学空间3D虚拟筛选新模式
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计算大环ALK抑制剂的全局构象张力能
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2024-05-30
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