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关于用分子对接预测结合亲和力的问题

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人们喜欢用分子对接预测化合物的结合亲和力以解释化合物的活性差异。经常有人吐槽：对接对化合物活性排序非常不准。因此本文的主…
Lead Finder 分子对接性能测试

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本文用CASF-2013数据集测试了Lead Finder的采样性能与打分性能。结果表明：重复进行3次计算，取打分最高前…
Flare 教程 | 分子对接-结合模式预测

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本教程演示了Flare的对接计算流程，包括：1）PDB文件下载；2）受体、配体结构准备；3）配体的导入；4）分子对接计算…
十种分子对接软件的性能评估

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在本研究中，以PBDbind数据库(2014版)的2002个蛋白-配体复合物结构作为测试用数据集，评估了10个分子对接软…
虚拟筛选-分子对接还是药效团？

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药效团与分子对接技术是常用的两种数据库虚拟筛选方法，那么到底哪种方法更好、还是各有优势呢？中国科学院上海药物所药物发现与…
分子对接教程–用FRED进行虚拟筛选

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LigandScout教程–VINA分子对接

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Ligandscout是非常专业、易用的药物设计平台， 除了药效团建模与虚拟筛选外，还整合了分子对接软件AutoDock…
深度学习在药物发现与设计中的应用文献（持续更新）

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本文收集深度学习在药物发现、设计领域的应用，软件（源代码）、学习资源以及科技公司信息等。
Cresset的核心技术

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Cresset核心技术为XED力场在设计新的小分子生物活性化合物中的应用。XED力场通过复杂的原子描述来模拟远离原子中心…
FLARE V3特性预告：新技术与性能提升

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本文预告了Flare V3的部分新功能与性能改进。自由能微扰(FEP)计算相对结合自由能是该版本的最大亮点，已经用多种数…

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