搜索到 110 篇相关的文章

用多个蛋白信息来提高用单一蛋白结构分子对接虚拟筛选的性能

用多个蛋白信息来提高用单一蛋白结构分子对接虚拟筛选的性能

本文以PDE5A数据集为例，比较了使用单一apo结构的FRED分子对接虚拟筛选与使用多个holo结构的HYBRID分子对…
分子对接后处理——与指定残基发生特定相互作用配体的过滤

分子对接后处理——与指定残基发生特定相互作用配体的过滤

分子对接后处理可以提高分子对接虚拟筛选的性能。本文分享了如何用Flare的Python API来实现可视化分析的自动化处…
关于分子对接预测结合模式的问题

关于分子对接预测结合模式的问题

本文以Imatinib、dasatinib与ABL1激酶复合物结合模式为例，解释为什么分子对接并不是一件容易的事。
基于药效团、分子对接、分子形状的深度增强学习结构生成案例汇总

基于药效团、分子对接、分子形状的深度增强学习结构生成案例汇总

深度生成模型已用来进行从头分子设计，能够生成性质理想的化合物。然而，大部分深度生成模型的性质并不包含比如形状、药效团以及…
SPARK V10.6发布：新增分子对接功能与改进搜索算法

SPARK V10.6发布：新增分子对接功能与改进搜索算法

Spark V10.6是骨架跃迁和生物等排体替换工具SPARK的最新版。它赋能药物化学家和计算化学家们在药物发现项目中使…
Cloudam教程 | AutoDock Vina分子对接软件的使用

Cloudam教程 | AutoDock Vina分子对接软件的使用

本文演示了如何用Pymol与Openbabel从蛋白复合物结构出发准备AutoDock Vina计算所需的蛋白结构文件、…
用常规分子对接进行共价抑制剂的虚拟筛选

用常规分子对接进行共价抑制剂的虚拟筛选

本文演示了如何用受体立体碰撞消除（SCAR）法进行共价抑制剂的分子对接虚拟筛选：将常规分子对接虚拟筛选与Ligandsc…
关于用分子对接预测结合亲和力的问题

关于用分子对接预测结合亲和力的问题

人们喜欢用分子对接预测化合物的结合亲和力以解释化合物的活性差异。经常有人吐槽：对接对化合物活性排序非常不准。因此本文的主…
Lead Finder 分子对接性能测试

Lead Finder 分子对接性能测试

本文用CASF-2013数据集测试了Lead Finder的采样性能与打分性能。结果表明：重复进行3次计算，取打分最高前…
Flare 教程 | 分子对接-结合模式预测

Flare 教程 | 分子对接-结合模式预测

本教程演示了Flare的对接计算流程，包括：1）PDB文件下载；2）受体、配体结构准备；3）配体的导入；4）分子对接计算…

关注我们 么么哒！

最新文章

热门标签

高斯骨质疏松骨架跃迁靶点预测靶标预测非经典相互作用非极性分子静电相似性静电势静电互补性静电隧道阿斯利康闭壳层键解离能

友情链接

大家都在搜

微信公众号

微信公众号