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用常规分子对接进行共价抑制剂的虚拟筛选

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本文演示了如何用受体立体碰撞消除（SCAR）法进行共价抑制剂的分子对接虚拟筛选：将常规分子对接虚拟筛选与Ligandsc…
关于用分子对接预测结合亲和力的问题

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人们喜欢用分子对接预测化合物的结合亲和力以解释化合物的活性差异。经常有人吐槽：对接对化合物活性排序非常不准。因此本文的主…
Lead Finder 分子对接性能测试

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本文用CASF-2013数据集测试了Lead Finder的采样性能与打分性能。结果表明：重复进行3次计算，取打分最高前…
Flare 教程 | 分子对接-结合模式预测

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十种分子对接软件的性能评估

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在本研究中，以PBDbind数据库(2014版)的2002个蛋白-配体复合物结构作为测试用数据集，评估了10个分子对接软…
虚拟筛选-分子对接还是药效团？

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药效团与分子对接技术是常用的两种数据库虚拟筛选方法，那么到底哪种方法更好、还是各有优势呢？中国科学院上海药物所药物发现与…
分子对接教程–用FRED进行虚拟筛选

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LigandScout教程–VINA分子对接

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Ligandscout是非常专业、易用的药物设计平台， 除了药效团建模与虚拟筛选外，还整合了分子对接软件AutoDock…
侧链虚拟筛选：全PDB和ChEMBL数据分析

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药物化学的优化通常涉对分子的一部分进行替换设计，其目的是在保留化合物活性的同时提高化合物的其他性能。在本研究中，作者进行…
云计算教程 | 在云端用VirtualFlow实现超高通量虚拟筛选

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VirtualFlow是一款开源的、基于结构的、超高通量虚拟筛选平台，Gorulla等人成功地用8000个核心花两周时间…

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