分子对接 Archives - 墨灵格的博客

关于用分子对接预测结合亲和力的问题

人们喜欢用分子对接预测化合物的结合亲和力以解释化合物的活性差异。经常有人吐槽：对接对化合物活性排序非常不准。因此本文的主…

原创文章
小墨
Docking
2019-04-30
3,270
6

Lead Finder教程 | 基于结构的虚拟筛选

Lead Finder是一款分子对接软件，本文以TK激酶抑制剂的虚拟筛选为例，演示了如何用Lead Finder对化合物…

原创文章
小墨
Cresset
2017-11-17
2,059
2

Flare 教程 | 分子对接-结合模式预测

本教程演示了Flare的对接计算流程，包括：1）PDB文件下载；2）受体、配体结构准备；3）配体的导入；4）分子对接计算…

小墨
Cresset
2017-06-04
3,443
0

基于结构的设计软件Flare测试邀请函

Flare是一款开创性的蛋白-配体分析与设计软件，它整合了当今最尖端的开源与商业技术，为基于结构的设计带来了新视角。Fl…

原创文章
小墨
Cresset
2017-04-21
2,526
4

十种分子对接软件的性能评估

在本研究中，以PBDbind数据库(2014版)的2002个蛋白-配体复合物结构作为测试用数据集，评估了10个分子对接软…

原创文章
小墨
Docking
2017-02-08
12,246
36

虚拟筛选-分子对接还是药效团？

药效团与分子对接技术是常用的两种数据库虚拟筛选方法，那么到底哪种方法更好、还是各有优势呢？中国科学院上海药物所药物发现与…

原创文章
小墨
drug design
2017-02-01
4,559
1

分子对接教程–用FRED进行虚拟筛选

FRED是OpenEye OEDocking软件包的一个分子对接程序，它将化合物数据库对接到一个受体口袋里进行结合模式预…

小墨
Docking
2016-09-15
3,916
0

虚拟筛选假阳性、假阴性产生的原因

本文通过比较高通量筛选（HTS）与虚拟筛选（VS），讨论了分子对接虚拟筛选产生假阳性与假阴性的原因, 发现不合适的分子内…

小墨
分子对接
2016-07-03
4,062
6

LigandScout教程–VINA分子对接

Ligandscout是非常专业、易用的药物设计平台，除了药效团建模与虚拟筛选外，还整合了分子对接软件AutoDock…

原创文章
小墨
AutoDock
2016-04-04
8,508
2

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