首页 › Benchmarking
基于结构的过滤提高分子对接虚拟筛选的富集性能

基于结构的过滤提高分子对接虚拟筛选的富集性能

本文以DUD-E的NRAM为子集为例，演示了如何用Flare的相互作用分析对Lead Finder分子对接虚拟筛选结果进…
用基于结构的过滤提高分子对接虚拟筛选的效率

用基于结构的过滤提高分子对接虚拟筛选的效率

本文以DUD-E PDE5A子集为例，演示了如何用Flare的相互作用分析来对Uni-Dock结果进行基于结构的过滤，在…
警惕虚拟筛选性能测试的结论——选择合理的蛋白结构来提高富集性能

警惕虚拟筛选性能测试的结论——选择合理的蛋白结构来提高富集性能

本文以DUD-E的靶标HIV PR为例，演示了蛋白结构选择对虚拟筛选性能的影响。具体的讲，当使用PDB 1XL2作为分子…
用数据融合增强分子对接的虚拟筛选性能

用数据融合增强分子对接的虚拟筛选性能

本文以DUD-E的EGFR子集为例，在Flare Docking的虚拟筛选模式下对Actives与Decoys进行了分子…
在基于配体3D相似性的虚拟筛选中使用Tversky

在基于配体3D相似性的虚拟筛选中使用Tversky

本文介绍了基于配体3D相似性计算两种主要方法Tanimoto与Tversky，并将ROCS Tversky相似性方法与文…
OEDocking——信息用的越多，虚拟筛选性能越好

OEDocking——信息用的越多，虚拟筛选性能越好

本文用DUDE+数据集对OEDocking使用单一apo结构的FRED分子对接、单一holo结构的HYBRID分子对接（…
ROCS——用形状技术进行高效的虚拟筛选

ROCS——用形状技术进行高效的虚拟筛选

本文用DUDE数据集对基于配体的ROCS虚拟筛选方法进行了性能评估，评估指标包括总体性能ROC AUC、早期富集能力lo…
用多个蛋白信息来提高用单一蛋白结构分子对接虚拟筛选的性能

用多个蛋白信息来提高用单一蛋白结构分子对接虚拟筛选的性能

本文以PDE5A数据集为例，比较了使用单一apo结构的FRED分子对接虚拟筛选与使用多个holo结构的HYBRID分子对…
用系综虚拟筛选策略提高基于药效团模型的虚拟筛选性能——PDE5A抑制剂虚拟筛选案例分析

用系综虚拟筛选策略提高基于药效团模型的虚拟筛选性能——PDE5A抑制剂虚拟筛选案例分析

人们已经证明系综虚拟筛选策略可以提高基于配体与基于分子对接虚拟筛选方法的性能，但能否提高基于药效团虚拟筛选方法的性却没有…

关注我们 么么哒！

最新文章

热门标签

高斯骨质疏松骨架跃迁靶点预测靶标预测非经典相互作用非极性分子静电相似性静电势静电互补性静电隧道阿斯利康闭壳层键解离能

友情链接

大家都在搜

微信公众号

微信公众号