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克服药物发现与开发的关键挑战——用AI技术预测ADMET
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计算大环ALK抑制剂的全局构象张力能
本文以大环ALK抑制剂Lorlatinib发现过程中活性差异20倍的一个分子对为例,演示了它们的构象张力能计算以评估其结…
原创文章
小墨
Conformational control
2024-06-03
553
0
用计算构象预组织对大环CDK2抑制剂设计进行优先级排序
在本文中,我们用计算构象预组织(conformational pre-organization)分析了活性跨度为2个数量…
原创文章
小墨
Conformational control
2024-05-14
1,015
0
用计算方法研究大环分子的构象预组织——BCL6抑制剂的案例分析
本文介绍了构象预组织概念、理论计算方法及其在药物设计中的应用。根据这个理论,人们预期化合物的结合亲和力正比于其构象系综中…
原创文章
小墨
Conformational control
2024-05-06
829
0
噁拉戈利(Elagolix)阻转异构体的QM扭转角分析
本文介绍了阻转异构体的概念,并以抗痛经药物噁拉戈利(Elagolix)为例,演示了如何用Flare QM对模型分子进行扭…
原创文章
小墨
Conformational control
2024-04-30
494
0
分子内硫-孤对电子相互作用
本文以一对结构仅一个原子差异但活性有65倍差异的Factor Xa抑制剂为例,分别用GNINA分子对接与Flare QM…
原创文章
小墨
Conformational control
2024-04-14
777
0
用QM构象张力能来对多样的生物等排体母核进行优先级排序
本文介绍一个基于Flare QM的工作流来对不同母核化合物进行构象张力能计算,包括下面步骤:对化合物进行穷尽构象搜索、在…
原创文章
小墨
Conformational control
2024-03-20
580
0
QM扭转角分析——控制依鲁替尼芳香轴构象提高靶标选择性
在本文中,我们用Flare QM对Ibrutinib及其构象控制的衍生物进行了QM扭转角分析,绘制扭转角-激酶活性图。结…
原创文章
小墨
conformational design
2024-03-18
453
0
用扭转角分析解释完美的结合模式、实测活性令人失望的现象
本文用一对结合构象稳定、结合模式一致、分子对接打分区分不开活性的BAZ2A/B抑制剂5、7为例,模拟了结合模式完美、打分…
原创文章
小墨
conformational design
2024-03-13
1,266
0
在基于结构的设计中用QM扭转角分析研究构象效应
GSK的Senger等人结合结构生物学与量子化学计算方法,确认了一对仅一个价键差异的分子,其20多倍的生物活性差异是由构…
原创文章
小墨
Conformational control
2024-03-03
810
0
锁定生物活性构象增强活性
本文以HNE抑制剂为例来演示如何用Flare QM的Torsion Profile来评估化合物构象能偏好,复现了从化合物…
原创文章
小墨
Conformational control
2024-02-15
614
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