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使用Flare™ FEP进行精确结合亲和力的计算——三个GPCR基准测试结果令人鼓舞
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用基于结构的过滤提高分子对接虚拟筛选的效率
本文以DUD-E PDE5A子集为例,演示了如何用Flare的相互作用分析来对Uni-Dock结果进行基于结构的过滤,在…
原创文章
小墨
Benchmarking
2023-09-24
1,981
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JAK3共价抑制剂激酶铰链区结合片段的虚拟筛选、裁剪与移植
本文以JAK3共价抑制剂PF-06651600为例,演示了如何用Ligandscout的药效团片段筛选方法对片段数据库进…
原创文章
小墨
AutoT&T 2
2021-06-28
2,534
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计算赋能工作流识别全新KRAS
G12C
共价别构抑制剂
本文用Ilib Diverse重现了拜尔公司Mortier等人的计算赋能工作流识别全新KRAS G12C共价抑制剂中的组…
原创文章
小墨
Ligandscout
2021-05-25
3,384
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LigandScout案例 | 基于结构的虚拟筛选发现新的碳酸酐酶VII型抑制剂
哺乳动物碳酸酐酶hCA VII主要表达于大脑并与多个神经生理与疾病相关,其选择性抑制剂可用于治疗癫痫和神经性疼痛。作者借…
原创文章
小墨
Ligandscout
2019-05-10
2,284
0
三维药效团搜索发展史
本文作者Van Drie JH是BioCAD(其产品为Catalyst软件,后来被Accelrys收购)的发起人之一。在…
原创文章
小墨
Pharmacophore
2019-04-05
3,918
2
Ligandscout教程 | 基于片段的虚拟筛选联用AutoT&T进行从头设计
本文演示了如何将Ligandscout的基于片段虚拟筛选与AutoT&T 2联合使用,实现化合物的从头设计。首先用Lig…
原创文章
小墨
AutoT&T 2
2018-08-31
4,441
2
Ligandscout教程 | 共价键药效团模型与虚拟筛选
本文以EGFR Kinase-Afatinia复合物为例来演示如何用Ligandscout基于结构的方法生成带共价键特征…
原创文章
小墨
Ligandscout
2018-05-15
5,468
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LigandScout | 最新版本4.2发布
Ligandscout是一款优秀的药物设计设计软件,提供基于结构的药效团识别、基于配体的药效团识别、高性能构象搜索、虚拟…
原创文章
小墨
drug design
2017-12-07
6,175
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Ligandscout教程 | 2D图展示配体-受体相互作用
本教程展示了如何用Ligandscout生成配体-蛋白相互作用2D图,并用鼠标编辑氨基酸的位置,保存为图片,调整图片的分…
小墨
drug design
2017-09-28
6,766
2
Ligandscout案例 | HIV-1整合酶与LEDGF/p75蛋白-蛋白相互作用小分子抑制剂的发现
晶状体上皮衍生生长因子(LEDGF)或转录共活化因子p75(LEDGF/p75)在HIV整合中起到至关重要的作用。HIV…
小墨
drug design
2017-09-08
4,071
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鸡蛋花素的ECD光谱计算
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分子内硫-孤对电子相互作用
2024-04-14
虚拟筛选——从CB1结合剂中筛选出对CB2具有选择性的先导化合物
2024-04-10
避免虚拟筛选时的化学类型偏好——用3D静电场与形状描述符来探索多样的化学空间
2024-04-03
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