卤键 Archives - 墨灵格的博客

用OEChem分析Asciminib与ABL的相互作用

OEChem不仅是一个强大的数据整合工具，而且还是强大的蛋白-配体相互作用分析工具。本文以最近上市的ABL别构抑制剂As…

我们提出了一种新方法，可以从PDB的挖掘中获得蛋白-配体原子对的相互作用倾向。为了确保得到可靠的统计，我们使用视线接触过…

罗氏的科学家们分享了一系列小分子药物发现案例，在这些案例中计算方法前瞻性地影响了罗氏的研究项目，目的是凸显那些能够实际带…

本文介绍了氢键（H-Bond）、卤键（X-Bond）、分子间相互作用能以及基组重叠误差（BSSE）等相关概念。并以HF与…

Cresset核心技术为XED力场在设计新的小分子生物活性化合物中的应用。XED力场通过复杂的原子描述来模拟远离原子中心…

在基于结构的药物设计领域中，蛋白质电负性原子与配体卤素原子之间的卤键相互作用日益受到关注。本文的研究者分析了配体卤原子和…

本文是对黄牛老师课题组水分子的卤键替换策略的实践，重现了论文中的AK算例：从复合物晶体结构(PDB code: 1LII…