骨架跃迁 Archives - 墨灵格的博客

片段虚拟筛选发现新的KRAS^G12C共价抑制剂

在本算例中，我们以6TAM的共晶配体为先导化合物，用LigandScout基于结构的方法识别药效团并搜索ZINC双环片段…

原创文章
小墨
AutoT&T 2
2021-06-22
1,000
0

计算赋能工作流识别全新KRAS^G12C共价别构抑制剂

本文用Ilib Diverse重现了拜尔公司Mortier等人的计算赋能工作流识别全新KRAS G12C共价抑制剂中的组…

原创文章
小墨
Ligandscout
2021-05-25
1,388
2

KRAS抑制剂MRTX849骨架跃迁引入新的相互作用

本文详述了如何以MTRX849系列化合物为起始分子，以docking为打分函数，用Spark虚拟筛选VeryCommon…

原创文章
小墨
Cresset
2021-04-25
1,674
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从活性位点里发现新的蛋白-配体相互作用

1H-吲唑-3-甲酰胺类化合物1是全新的ATP-竞争性GSK-3β抑制剂，它具有良好的激酶选择性、PK特性和药效，但其h…

原创文章
小墨
Cresset
2021-01-23
1,171
1

SPARK webinar 分子对接分子生长骨架跃迁

网络研讨会 | 用SPARK帮你突破现有技术设计的限制（附视频回放）

本视频演示了如何用SPARK进行骨架跃迁与分子生长以突破现有技术或知识产权的限制、获得具有独立知识产权的新化合物。还演示了即将发布的新版SPARK的特性：用基于结构的方法（分子对接方法）进行分子生长。

原创文章
小墨
Cresset
2020-11-08
705
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侧链虚拟筛选：全PDB和ChEMBL数据分析

药物化学的优化通常涉对分子的一部分进行替换设计，其目的是在保留化合物活性的同时提高化合物的其他性能。在本研究中，作者进行…

原创文章
小墨
Cresset
2020-08-02
2,050
2

真实世界的分子设计

罗氏的科学家们分享了一系列小分子药物发现案例，在这些案例中计算方法前瞻性地影响了罗氏的研究项目，目的是凸显那些能够实际带…

原创文章
小墨
ligand-based
2020-01-23
3,346
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文献重现 | 大环EGFR激酶抑制剂BI-4020的先导化合物5与6的发现与设计

本文重现了Boehringer Ingelheim的科学家在设计大环EGFR激酶抑制剂BI-4020时先导化合物5与6发…

原创文章
小墨
Cresset
2020-01-18
3,065
3

用SPARK基团替换策略重现深度学习DDR1抑制剂的发现

本文以DDR1抑制剂Ponatinib为起始化合物，用SPARK对其进行了基团替换计算实验。结果表明，SPARK在不到1…

原创文章
小墨
Cresset
2019-09-05
3,114
4

用ADMET Predictor与SPARK重现和记黄埔的PI3Kγ/δ双重抑制剂优化的过程

以临床药物为先导化合物进行DMPK、结合亲和力与选择性优化是药物发现的一个策略。本文用ADMET Predictor与S…

原创文章
小墨
Cresset
2019-06-24
2,803
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