骨架跃迁 Archives - 墨灵格的博客

真实世界的分子设计

罗氏的科学家们分享了一系列小分子药物发现案例，在这些案例中计算方法前瞻性地影响了罗氏的研究项目，目的是凸显那些能够实际带…

原创文章
小墨
ligand-based
2020-01-23
1,564
5

文献重现 | 大环EGFR激酶抑制剂BI-4020的先导化合物5与6的发现与设计

本文重现了Boehringer Ingelheim的科学家在设计大环EGFR激酶抑制剂BI-4020时先导化合物5与6发…

原创文章
小墨
Cresset
2020-01-18
1,419
3

用SPARK基团替换策略重现深度学习DDR1抑制剂的发现

本文以DDR1抑制剂Ponatinib为起始化合物，用SPARK对其进行了基团替换计算实验。结果表明，SPARK在不到1…

原创文章
小墨
Cresset
2019-09-05
2,089
4

用ADMET Predictior与SPARK重现和记黄埔的PI3Kγ/δ双重抑制剂优化的过程

以临床药物为先导化合物进行DMPK、结合亲和力与选择性优化是药物发现的一个策略。本文用ADMET Predictor与S…

原创文章
小墨
Cresset
2019-06-24
1,871
0

OpenEye案例 | 和记黄埔强效、高选择性的PI3Kγ/δ双重抑制剂

喹唑啉酮是选择性PI3Kγ与PI3Kδ抑制剂的公共片段，在本研究中和记黄埔的科研人员用片段替换软…

原创文章
小墨
OpenEye
2019-06-10
802
0

诺华生物医学研究院用SPARK发现全新的LpxC抑制剂

诺华生物医学研究院使用骨架跃迁软件Spark对图1化合物6的吲唑母核进行骨架替换以发现代替品。经过对最有希望的、打分靠前…

原创文章
小墨
Cresset
2019-05-20
1,207
0

AutoT&T 2.0-高效的药物分子从头设计软件

AutoT&T(Automatic Tailoring and Transplanting)是一款具有我国自主知识产权的…

原创文章
小墨
基于结构的设计
2018-08-23
1,915
0

SPARK教程 | 共价结合抑制剂的骨架跃迁

本文以EGFR激酶共价抑制剂Afatinib为例，描述了如何用SPARK的共价药效团特征进行共价抑制剂弹头的结构替换（跃…

原创文章
小墨
Cresset
2018-07-24
1,508
1

案例 | 骨架跃迁发现发现新型选择性LSD1抑制剂(JMC2017)

本文分享了Mould等人如何从高通量筛选发现苗头化合物、再用骨架跃迁进行苗头化合物的优化、结合文献信息进一步修饰化合物与…

小墨
Cresset
2017-10-22
1,613
0

案例 | 骨架跃迁优化选择性可逆性LSD1抑制剂剂(BMCL2017)

现有LSD1可逆抑制剂GSK-690同时也是hERG抑制剂，这限制了该类化合物的开发。为了发现更好的LSD1抑制剂，作者…

小墨
Cresset
2017-10-21
1,681
0

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案例 | 骨架跃迁发现发现新型选择性LSD1抑制剂(JMC2017)

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