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使用Flare™ FEP进行精确结合亲和力的计算——三个GPCR基准测试结果令人鼓舞
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在线会议 | 计算结合于磷脂/膜界面P2Y1 GPCR配体的结合亲和力
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OpenEye | 化合物数据库的准备
为了对大型数据库进行搜索以发现潜在的活性化合物,需要对数据库进行合理的准备。本文系统论述了小分子数据库结构准备需要考虑的…
原创文章
小墨
OpenEye
2020-09-09
5,748
1
JAK抑制剂的3D-QSAR研究
Forge可以用基于场的QSAR或机器学习方法来建立健壮、预测性的QSAR模型[1]。此类模型的构建要求数据集化合物具有…
原创文章
小墨
3D-QSAR
2020-03-08
3,190
0
真实世界的分子设计
罗氏的科学家们分享了一系列小分子药物发现案例,在这些案例中计算方法前瞻性地影响了罗氏的研究项目,目的是凸显那些能够实际带…
原创文章
小墨
ligand-based
2020-01-23
5,870
10
TDDFT计算ECD光谱指认绝对构型的良好计算规范
手性的量子力学计算已迅速成为归属有机化合物(包括天然产物)绝对构型(absolute configuration, AC…
原创文章
小墨
ECD
2020-01-22
9,326
9
CONFLEX教程 | 两面角的分布
很多场合需要用到两面角分布,比如轴手性分子的立体化学结构确证。本文详述了如何利用CONFLEX构象搜索的结果,获取两面角…
原创文章
小墨
CONFLEX
2017-11-30
3,497
2
CONFLEX教程 | CONFLEX构象搜索时如何约束两面角
CONFLEX是一款构象搜索软件,本文描述了如何在CONFLEX构象搜索时约束化合物的两面角于特定的角度。
原创文章
小墨
CONFLEX
2017-06-30
3,313
0
教程 | OMEGA构象搜索
OMEGA负责生成小分子的3D构象,专门为计算机辅助药物设计中大规模数据库化合物的构象分析而设计,它可快速、可靠地产生多…
原创文章
小墨
OMEGA
2017-06-16
4,945
1
Torch教程–分子叠合
Torch是Cresset公司专为药物化学家而定制的药物设计软件,可以用来进行化合物的构象搜索、分子叠合、分子形状与静电…
小墨
Cresset
2016-06-04
7,548
1
Torch教程–构象搜索
Torch是专为药物化学科研人员设计的药物设计软件,提供了方便的计算工具进行化合物构象搜索、分子叠合、分子形状与静电场比…
原创文章
小墨
Cresset
2016-06-04
7,406
2
CONFLEX教程 | 主客体构象搜索教程
主-客体构型搜索(Host-Ligand Coordination Search)与分子团簇(molecular clu…
原创文章
小墨
CONFLEX
2016-04-13
5,105
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分子内硫-孤对电子相互作用
虚拟筛选——从CB1结合剂中筛选出对CB2具有选择性的先导化合物
2024-04-10
避免虚拟筛选时的化学类型偏好——用3D静电场与形状描述符来探索多样的化学空间
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配体熵很难但不应被忽略
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基于结构虚拟筛选的科学与艺术
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