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使用Flare™ FEP进行精确结合亲和力的计算——三个GPCR基准测试结果令人鼓舞
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CT7001的CDK7/CDK2激酶靶标选择性分析
本文从激酶特性结合子口袋分析、相互作用分析与生物活性构象稳定性分析等三个角度考察了CT7001对CDK7与CDK2激酶选…
原创文章
小墨
FreeForm
2022-05-31
3,521
1
用张力能评估构象稳定性及其在先导化合物优化中的应用——更多力场选择
本文用两对化学结构仅一个原子差异但活性相差巨大的分子对为例,尝试用FreeForm以不同的力场计算张力能来解释活性差异的…
小墨
OpenEye
2022-02-08
3,760
0
文献重现 | 大环EGFR激酶抑制剂BI-4020的先导化合物5与6的发现与设计
本文重现了Boehringer Ingelheim的科学家在设计大环EGFR激酶抑制剂BI-4020时先导化合物5与6发…
原创文章
小墨
Cresset
2020-01-18
6,232
4
OpenEye案例 | 用FreeForm改善MM/PBSA计算结合自由能
在本研究中,作者用MM/PBSA方法预测配体的EcR结合活性。首先 使用40个已知EcR配体的验证研究表明,当引入配体的…
原创文章
小墨
OpenEye
2019-06-05
5,076
0
FreeForm–构象稳定性评估及其在先导化合物优化中的应用
需要不需要对线型先导物进行构象约束以获得更好的衍生物?这是药物化学工作者常常面临的一个问题。最直接的做法是合成出化合物,…
原创文章
小墨
OpenEye
2016-07-02
7,520
7
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在学术写作中使用ChatGPT三种方式
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