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用场技术与水分析技术指导卤键理性设计——以hCatL抑制剂为例
26.02.17
静态结构的陷阱与水热力学的启示——ATX 抑制剂 GLPG1690 先导化合物优化回溯性研究
26.02.11
FKBP结合位点水合热力学重新审视——Flare GIST与Deep GIST的对比研究
26.01.16
GIST 结合位点水分析在先导化合物优化中的应用 —— 以 15-PGDH 抑制剂设计为例
25.12.16
静电互补性分析:一种高效替代FEP的配体优化策略——以MALT1别构抑制剂为例
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用场技术与水分析技术指导卤键理性设计——以hCatL抑制剂为例
Wang等人提出的卤键理性设计策略强调通过卤素原子替换与骨架羰基形成氢键的结合位点水分子。 ...
用SPARK水分子替换实验重现MRTX1719基于片段的发现
在本文中,我们利用计算方法重现了新型合成致死药物MRTX1719的基于片段的发现过程。 ...
用XED场技术与SQM分析分子间硫-氧/氮孤对电子相互作用
除了在硫与氮/氧孤对电子之间发生有利的相互作用之外,在硫原子与氧或氮原子的孤对电子之间还可能发生对结合不利的排斥相互作用 ...
从肽到小分子——分而治之策略重现NNMT抑制剂的设计
本文以田野义小分子NNMT抑制剂的发现为例,联合使用Flare与Spark采用分而治之的策略重现了田野义从肽到小分子的发 ...
将静电与水的分析作为基于结构设计的核心
Flare的蛋白相互作用势和配体场是理解配体-蛋白相互作用静电特性的有力方法。 ...
综合利用基于结构与基于配体的方法理解SD抑制剂的SAR
小柱孢酮脱水酶(Scytalone Dehydratase,SD)抑制剂可以保护水稻免受稻瘟病菌引起的病害。 ...
借助重要的水加速基于结构的ATX抑制剂先导化合物优化
自分泌运动因子 (ATX) 抑制剂 GLPG1690 的临床开发虽终止,但其先导化合物优化过程具有重要的方法学借鉴意义。 ...
基于结构与配体的方法协同研究RIPK1抑制剂的SAR
从探索化学空间到先导化合物优化,理解结构-活性关系(SAR)是药物发现诸多方面的基础工作。 ...
Cresset的核心技术
Cresset核心技术为XED力场在设计新的小分子生物活性化合物中的应用。 ...
比较BTK抑制剂的配体与蛋白静电势
本文用Flare内置的蛋白相互作用势分析方法来计算BTK激酶活性位点里精细的静电特征。 ...
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