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使用Flare™ FEP进行精确结合亲和力的计算——三个GPCR基准测试结果令人鼓舞
24.01.26
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24.01.25
Flare V8新特性介绍
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在线会议 | 计算结合于磷脂/膜界面P2Y1 GPCR配体的结合亲和力
23.12.10
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从肽到小分子——分而治之策略重现NNMT抑制剂的设计
本文以田野义小分子NNMT抑制剂的发现为例,联合使用Flare与Spark采用分而治之的策略重现了田野义从肽到小分子的发…
原创文章
小墨
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2023-04-10
2,064
0
将静电与水的分析作为基于结构设计的核心
Flare的蛋白相互作用势和配体场是理解配体-蛋白相互作用静电特性的有力方法。结合位点里的水分子对蛋白相互作用势的计算非…
小墨
Cresset
2022-02-04
1,372
0
综合利用基于结构与基于配体的方法理解SD抑制剂的SAR
小柱孢酮脱水酶(Scytalone Dehydratase,SD)抑制剂可以保护水稻免受稻瘟病菌引起的病害。本文以相差仅…
小墨
Cresset
2021-09-14
2,833
1
借助重要的水加速基于结构的ATX抑制剂先导化合物优化
比利时生物制药公司Galapagos针对自分泌运动因子(Autotaxin, ATX)开发的First-in-class…
小墨
Cresset
2021-08-23
3,333
0
双水记——水分子替换而活性降低的理论解释
2012年辉瑞公司的Trujillo等人在 “双水记(a tale of two waters)”一文描述了对hH-PG…
原创文章
小墨
Flare
2021-07-25
3,304
0
基于结构与配体的方法协同研究RIPK1抑制剂的SAR
从探索化学空间到先导化合物优化,理解结构-活性关系(SAR)是药物发现诸多方面的基础工作。在本算例中,使用Forge的A…
原创文章
小墨
Cresset
2021-04-02
3,151
1
Cresset的核心技术
Cresset核心技术为XED力场在设计新的小分子生物活性化合物中的应用。XED力场通过复杂的原子描述来模拟远离原子中心…
原创文章
小墨
Cresset
2019-10-08
2,724
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比较BTK抑制剂与蛋白静电势
本文用Flare内置的蛋白相互作用势分析方法来计算BTK激酶活性位点里精细的静电特征。相互作用势图用于比较几个精选的BT…
小墨
Cresset
2019-05-19
3,057
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2024-04-14
分子内硫-孤对电子相互作用
虚拟筛选——从CB1结合剂中筛选出对CB2具有选择性的先导化合物
2024-04-10
避免虚拟筛选时的化学类型偏好——用3D静电场与形状描述符来探索多样的化学空间
2024-04-03
配体熵很难但不应被忽略
2024-03-30
基于结构虚拟筛选的科学与艺术
2024-03-28
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