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超大化学空间3D虚拟筛选新模式

超大化学空间3D虚拟筛选新模式

虚拟筛选的局限性是由数据存储和处理所带来，任何超过对1亿个化合物的筛选都会带来问题。本文描述了一种全新的方法——Igni…
识别新化学类型的虚拟筛选策略

识别新化学类型的虚拟筛选策略

本文介绍了如何应用基于结构、基于配体的虚拟筛选方法发现新的化学类型。
虚拟筛选——从CB1结合剂中筛选出对CB2具有选择性的先导化合物

虚拟筛选——从CB1结合剂中筛选出对CB2具有选择性的先导化合物

通过将基于结构的计算方法、结构生物学和化学知识与基于配体的计算方法相结合，可以优化虚拟筛选的起点，识别可能具有改善的受体…
避免虚拟筛选时的化学类型偏好——用3D静电场与形状描述符来探索多样的化学空间

避免虚拟筛选时的化学类型偏好——用3D静电场与形状描述符来探索多样的化学空间

通过一个热门的疟疾靶标，阐述了独特的3D Cresset场技术比常用2D指纹相似性方法的优势，并举例说明了BLAZE虚拟…
基于结构虚拟筛选的科学与艺术

基于结构虚拟筛选的科学与艺术

药物发现各个阶段的高损耗率推动了人们探索更大化学空间的需求，基于结构虚拟筛选因此而势头正盛。本文从贝叶斯的角度讨论了其作…
基于配体的虚拟筛选发现高亲和力淀粉样蛋白配体

基于配体的虚拟筛选发现高亲和力淀粉样蛋白配体

纤维蛋白聚集是神经退行性疾病的特征，但也是难以进行配体设计的代表性靶标，因为关于结合位点的结构信息有限。在本文中，用基于…
基于结构的过滤提高分子对接虚拟筛选的富集性能

基于结构的过滤提高分子对接虚拟筛选的富集性能

本文以DUD-E的NRAM为子集为例，演示了如何用Flare的相互作用分析对Lead Finder分子对接虚拟筛选结果进…
对最有前景的虚拟筛选苗头化合物进行优先级排序

对最有前景的虚拟筛选苗头化合物进行优先级排序

本文演示了如何连用Blaze与Flare对虚拟筛选苗头化合物进行优先级排序来发现靶向TYK2 JH1假激酶结构域的抑制剂…
用基于结构的过滤提高分子对接虚拟筛选的效率

用基于结构的过滤提高分子对接虚拟筛选的效率

本文以DUD-E PDE5A子集为例，演示了如何用Flare的相互作用分析来对Uni-Dock结果进行基于结构的过滤，在…
警惕虚拟筛选性能测试的结论——选择合理的蛋白结构来提高富集性能

警惕虚拟筛选性能测试的结论——选择合理的蛋白结构来提高富集性能

本文以DUD-E的靶标HIV PR为例，演示了蛋白结构选择对虚拟筛选性能的影响。具体的讲，当使用PDB 1XL2作为分子…

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