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克服药物发现与开发的关键挑战——用AI技术预测ADMET
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使用Flare™ FEP进行精确结合亲和力的计算——三个GPCR基准测试结果令人鼓舞
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Docking
虚拟筛选——从CB1结合剂中筛选出对CB2具有选择性的先导化合物
通过将基于结构的计算方法、结构生物学和化学知识与基于配体的计算方法相结合,可以优化虚拟筛选的起点,识别可能具有改善的受体…
原创文章
小墨
Cresset
2024-04-10
554
0
基于结构的过滤提高分子对接虚拟筛选的富集性能
本文以DUD-E的NRAM为子集为例,演示了如何用Flare的相互作用分析对Lead Finder分子对接虚拟筛选结果进…
原创文章
小墨
Benchmarking
2023-10-12
1,376
0
用基于结构的过滤提高分子对接虚拟筛选的效率
本文以DUD-E PDE5A子集为例,演示了如何用Flare的相互作用分析来对Uni-Dock结果进行基于结构的过滤,在…
原创文章
小墨
Benchmarking
2023-09-24
2,198
0
警惕虚拟筛选性能测试的结论——选择合理的蛋白结构来提高富集性能
本文以DUD-E的靶标HIV PR为例,演示了蛋白结构选择对虚拟筛选性能的影响。具体的讲,当使用PDB 1XL2作为分子…
原创文章
小墨
Benchmarking
2023-09-13
1,495
0
Flare™系综共价对接
系综共价对接(Ensemble Covalent Docking)是Flare最近引入的一个新功能。本文以脯氨酰寡肽酶(…
原创文章
小墨
Cresset
2023-08-06
757
1
用分子动力学模拟生成蛋白构象系综以用于生物学更加合理的分子对接实验
在本月初的网络研讨会上,我们展示了Flare中的分子动力学模拟和对接如何作为一种先进的研究技术而协同工作。在传统的对接模…
原创文章
小墨
Cresset
2023-04-23
2,080
0
从肽到小分子——分而治之策略重现NNMT抑制剂的设计
本文以田野义小分子NNMT抑制剂的发现为例,联合使用Flare与Spark采用分而治之的策略重现了田野义从肽到小分子的发…
原创文章
小墨
Cresset
2023-04-10
2,356
0
什么时候应该使用药效团约束
本文介绍了Cresset应用软件Flare,Blaze与Spark中的场约束与药效团约束,并讨论了这两种约束方法的差异与…
原创文章
小墨
BLAZE
2023-04-03
1,223
0
用多个蛋白信息来提高用单一蛋白结构分子对接虚拟筛选的性能
本文以PDE5A数据集为例,比较了使用单一apo结构的FRED分子对接虚拟筛选与使用多个holo结构的HYBRID分子对…
小墨
Benchmarking
2022-03-02
2,875
1
关于分子对接预测结合模式的问题
本文以Imatinib、dasatinib与ABL1激酶复合物结合模式为例,解释为什么分子对接并不是一件容易的事。
原创文章
小墨
Docking
2021-07-30
5,938
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超大化学空间3D虚拟筛选新模式
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2024-05-30
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