“闪烁”水对接——重建关键相互作用的策略

“闪烁”水对接——重建关键相互作用的策略

当前的分子对接评估通常侧重于几何精度（如RMSD），但可能忽视了结合模式的物理真实性。 ...
Deep Docking——一个增强的基于结构药物发现深度学习平台

Deep Docking——一个增强的基于结构药物发现深度学习平台

药物发现是一个严谨的过程，需要数十亿美元的投资和数十年的研究才能将分子从实验室带到病床边。 ...
虚拟筛选——从CB1结合剂中筛选出对CB2具有选择性的先导化合物

虚拟筛选——从CB1结合剂中筛选出对CB2具有选择性的先导化合物

通过将基于结构的计算方法、结构生物学和化学知识与基于配体的计算方法相结合，可以优化虚拟筛选的起点，识别可能具有改善的受体 ...
基于结构的过滤提高分子对接虚拟筛选的富集性能

基于结构的过滤提高分子对接虚拟筛选的富集性能

本文以DUD-E的NRAM为子集为例，演示了如何用Flare的相互作用分析对Lead Finder分子对接虚拟筛选结果进 ...
用基于结构的过滤提高分子对接虚拟筛选的效率

用基于结构的过滤提高分子对接虚拟筛选的效率

本文以DUD-E PDE5A子集为例，演示了如何用Flare的相互作用分析来对Uni-Dock结果进行基于结构的过滤，在 ...
警惕虚拟筛选性能测试的结论——选择合理的蛋白结构来提高富集性能

警惕虚拟筛选性能测试的结论——选择合理的蛋白结构来提高富集性能

本文以DUD-E的靶标HIV PR为例，演示了蛋白结构选择对虚拟筛选性能的影响。 ...
Flare™系综共价对接

Flare™系综共价对接

系综共价对接（Ensemble Covalent Docking）是Flare最近引入的一个新功能。 ...
用分子动力学模拟生成蛋白构象系综以用于生物学更加合理的分子对接实验

用分子动力学模拟生成蛋白构象系综以用于生物学更加合理的分子对接实验

在本月初的网络研讨会上，我们展示了Flare中的分子动力学模拟和对接如何作为一种先进的研究技术而协同工作。 ...
从肽到小分子——分而治之策略重现NNMT抑制剂的设计

从肽到小分子——分而治之策略重现NNMT抑制剂的设计

本文以田野义小分子NNMT抑制剂的发现为例，联合使用Flare与Spark采用分而治之的策略重现了田野义从肽到小分子的发 ...
什么时候应该使用药效团约束

什么时候应该使用药效团约束

本文介绍了Cresset应用软件Flare，Blaze与Spark中的场约束与药效团约束，并讨论了这两种约束方法的差异与 ...

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