共价抑制剂 Archives - 墨灵格的博客

片段虚拟筛选发现新的KRAS^G12C共价抑制剂

在本算例中，我们以6TAM的共晶配体为先导化合物，用LigandScout基于结构的方法识别药效团并搜索ZINC双环片段…

原创文章
小墨
AutoT&T 2
2021-06-22
1,743
0

计算赋能工作流识别全新KRAS^G12C共价别构抑制剂

本文用Ilib Diverse重现了拜尔公司Mortier等人的计算赋能工作流识别全新KRAS G12C共价抑制剂中的组…

原创文章
小墨
Ligandscout
2021-05-25
2,118
2

KRAS抑制剂MRTX849骨架跃迁引入新的相互作用

本文详述了如何以MTRX849系列化合物为起始分子，以docking为打分函数，用Spark虚拟筛选VeryCommon…

原创文章
小墨
Cresset
2021-04-25
2,708
0

网络研讨会 | 简化你的共价抑制剂设计(附视频回放)

近年来，共价抑制剂已成为药物发现中的一种流行方法。将配体共价结合到蛋白靶标上可能会带来药效和药代动力学优势，但同时也化合物必须具有选择性以减轻脱靶反应。本次网络研讨将重点介绍如何使用Flare和Lea…

原创文章
小墨
Cresset
2021-01-22
1,488
2

Gaussian教程 | Michael受体与巯基模型的加成反应和反应速率常数的计算

我们选取了四个Michael受体，分别计算了这些受体与巯基模型的加成反应、计算了能垒并构建了反应势能面。同时我们也介绍了…

原创文章
小墨
Gaussian
2020-03-28
6,140
9

用常规分子对接进行共价抑制剂的虚拟筛选

本文演示了如何用受体立体碰撞消除（SCAR）法进行共价抑制剂的分子对接虚拟筛选：将常规分子对接虚拟筛选与Ligandsc…

原创文章
小墨
Cresset
2020-03-22
6,110
3

2019-nCoV 3CL水解酶与抑制剂的复合物结构

由上海科技大学饶子和/杨海涛课题组测定的2019-nCoV冠状病毒3CL水解酶(Mpro)的高分率晶体结构于2020年2…

原创文章
小墨
Cresset
2020-02-06
5,647
5

Gaussian教程 | 用DFT预测Michael受体的遗传毒性(AMES test)

根据Grayson等人的研究结论：活化能小于20.7kcal/mol且ELUMO小于-1.85eV的Michael受体很…

原创文章
小墨
Gaussian
2020-01-08
3,918
1

可逆Michael受体硫醇加成反应的DFT理论计算

迈克尔（Michael）受体与半胱氨酸巯基加成是几种共价药物（例如afatinib、osimertinib、ibruti…

原创文章
小墨
Gaussian
2020-01-04
6,386
5

选择性JAK3抑制剂PF-06651600的设计

大量致力于JAK激酶抑制剂的发现工作最终将几种化合物推进到临床开发并有两个被FDA批准。尽管在过去20年中付出了巨大的努…

原创文章
小墨
基于结构的设计
2019-11-10
5,029
0

片段虚拟筛选发现新的KRAS^G12C共价抑制剂

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