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25.01.22
用SPARK生物等排体替换加速胺基甲酸酯 Cbl-b 抑制剂的发现
25.01.16
自适应Lambda调度——一种提高自由能微扰模拟计算效率的方法
25.01.15
3D-QSAR与Spark生物等排体替换联合使用——高效骨架跃迁设计新型FABP4抑制剂
25.01.11
药物化学设计的核心问题——Forge和Spark之间的协同关系
25.01.11
用Activity Atlas解决选择性问题
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用系综虚拟筛选策略提高基于药效团模型的虚拟筛选性能——PDE5A抑制剂虚拟筛选案例分析
人们已经证明系综虚拟筛选策略可以提高基于配体与基于分子对接虚拟筛选方法的性能,但能否提高基于药效团虚拟筛选方法的性却没有 ...
基于药效团、分子对接、分子形状的深度增强学习结构生成案例汇总
深度生成模型已用来进行从头分子设计,能够生成性质理想的化合物。 ...
使用深度生成模型设计具有所需药效团的DDR1抑制剂
本文描述了如何联合使用LigandScout与REINVENT实现深度生成模型 (DGM) 设计具有所需药效团的DDR1 ...
JAK3共价抑制剂激酶铰链区结合片段的虚拟筛选、裁剪与移植
本文以JAK3共价抑制剂PF-06651600为例,演示了如何用Ligandscout的药效团片段筛选方法对片段数据库进 ...
片段虚拟筛选发现新的KRAS
G12C
共价抑制剂
在本算例中,我们以6TAM的共晶配体为先导化合物,用LigandScout基于结构的方法识别药效团并搜索ZINC双环片段 ...
药效团模型的分层图表示
对于蛋白-配体相互作用模式的研究,目前有各种各样的采样方法允许快速访问大规模数据。 ...
新一代3D药效团模型
3D药效团模型是生物活性构象的配体以化学方式定义的相互作用的三维集合。 ...
用分子动力学模拟评估药效团特征稳定性
12个蛋白-配体体系的分子动力学模拟分别用于生成单一、基于结构的药效团模型,这些合并的模型联合使用了初始实验结构的信息与 ...
视频 | 药效团模拟——如何在药物发现早期提高虚拟筛选的效率
Thierry Langer教授是维也纳大学药化系主任,他共同开发的Ligandscout是药效团技术的最佳软件。 ...
真实世界的分子设计
罗氏的科学家们分享了一系列小分子药物发现案例,在这些案例中计算方法前瞻性地影响了罗氏的研究项目,目的是凸显那些能够实际带 ...
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在线会议 | 3D-QSAR与FEP联用主动学习对生物等排体进行优先级排序
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