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使用蛋白质-配体相互作用指纹(PLIF)对分子数据进行聚类
25.04.30
SPARK应用案例——RSV聚合酶抑制剂从DEL苗头到类药先导化合物的优化
25.04.22
选择性METTL3抑制剂EP652苗头化合物1的发现
25.04.20
增强CDPKit的药效团模型
25.04.18
计算药物发现工具——对发现过程的深入理解
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用静电互补性与分子对接打分对ACK1激酶抑制剂铰链结合片段进行优先级排序
本文深入分析了Flare两种轻量级LF VSscore与EC score打分方法对ACK1激酶抑制剂铰链结合片段优先级排 ...
在PROTAC设计中使用静电互补性
在本实验中,我们使用Spark生成新的PROTAC连接臂,然后用Flare中EC计算方法来评估这些新的PROTAC连接臂 ...
用静电分析TYK2 JH1抑制剂铰链结合片段的SAR
Flare的静电分析技术包括蛋白静电相互作用势(PIP),配体场与静电互补性(EC)分析。 ...
将水与静电分析作为基于结构设计的核心——BCL6与TYK2 JH2抑制剂算例
本文介绍了两个将水与静电分析作为基于结构设计核心的应用案例。 ...
探索更好的电荷模型
本文介绍了两种偏心电荷模型:XED电荷模型与Astex-DNN电荷模型。 ...
将静电与水的分析作为基于结构设计的核心
Flare的蛋白相互作用势和配体场是理解配体-蛋白相互作用静电特性的有力方法。 ...
用XED力场分析激酶抑制剂的C─H···O=C氢键
量子化学计算表明,C─H···O氢键相互作用强度相当强,大约是N─H···O氢键相互作用强度的一半。 ...
比较BTK抑制剂的配体与蛋白静电势
本文用Flare内置的蛋白相互作用势分析方法来计算BTK激酶活性位点里精细的静电特征。 ...
如何用静电互补性打分
静电互补性打分(EC Score)的基本思想是:当配体和受体的静电势匹配时(即具有相同的量值和相反的符号),实现配体和受 ...
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