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用SPARK生物等排体替换加速胺基甲酸酯 Cbl-b 抑制剂的发现
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自适应Lambda调度——一种提高自由能微扰模拟计算效率的方法
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3D-QSAR与Spark生物等排体替换联合使用——高效骨架跃迁设计新型FABP4抑制剂
25.01.11
药物化学设计的核心问题——Forge和Spark之间的协同关系
25.01.11
用Activity Atlas解决选择性问题
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用水的能量学信息重现KRAS
G12D
选择性抑制剂MRTX1133的哌嗪侧链优化过程
本文演示了如何用SZMAP/GAMEPLAN对KRAS G12D-化合物5B的共晶结构(PDB 7RT4)结合位点进行水 ...
KRAS
G12C
共价抑制剂MRTX849先导化合物优化过程中的水分子替换
本文以KRAS共价抑制剂MRTX849的先导化合物优化为例,说明水分子替换策略在先导化合物优化过程中的重要性。 ...
片段虚拟筛选发现新的KRAS
G12C
共价抑制剂
在本算例中,我们以6TAM的共晶配体为先导化合物,用LigandScout基于结构的方法识别药效团并搜索ZINC双环片段 ...
计算赋能工作流识别全新KRAS
G12C
共价别构抑制剂
本文用Ilib Diverse重现了拜尔公司Mortier等人的计算赋能工作流识别全新KRAS G12C共价抑制剂中的组 ...
KRAS抑制剂MRTX849骨架跃迁引入新的相互作用
本文详述了如何以MTRX849系列化合物为起始分子,以docking为打分函数,用Spark虚拟筛选VeryCommon ...
SPARK案例 | 拜尔发现通过干扰RAS-SOS1相互作用能够阻断RAS激活的SOS1抑制剂
本文叙述了拜尔公司科研人员用SPARK发现高效、选择性的SOS1抑制剂的研究过程:首先用片段筛选与高通量筛选发现了与SO ...
SZMAP | 水分子的稳定化自由能计算及其应用
本文对SZMAP计算的水能量学指标进行了总结,重点介绍了SZMAP稳定化自由能与中性水探针自由能差的概念、区别及其应用。 ...
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