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用水的能量学信息重现KRAS
G12D
选择性抑制剂MRTX1133的哌嗪侧链优化过程
本文演示了如何用SZMAP/GAMEPLAN对KRAS G12D-化合物5B的共晶结构(PDB 7RT4)结合位点进行水…
小墨
OpenEye
2022-05-16
3,597
0
KRAS
G12C
共价抑制剂MRTX849先导化合物优化过程中的水分子替换
本文以KRAS共价抑制剂MRTX849的先导化合物优化为例,说明水分子替换策略在先导化合物优化过程中的重要性。与经典的分…
小墨
Cresset
2021-08-30
4,076
0
片段虚拟筛选发现新的KRAS
G12C
共价抑制剂
在本算例中,我们以6TAM的共晶配体为先导化合物,用LigandScout基于结构的方法识别药效团并搜索ZINC双环片段…
原创文章
小墨
AutoT&T 2
2021-06-22
3,034
0
计算赋能工作流识别全新KRAS
G12C
共价别构抑制剂
本文用Ilib Diverse重现了拜尔公司Mortier等人的计算赋能工作流识别全新KRAS G12C共价抑制剂中的组…
原创文章
小墨
Ligandscout
2021-05-25
3,574
2
KRAS抑制剂MRTX849骨架跃迁引入新的相互作用
本文详述了如何以MTRX849系列化合物为起始分子,以docking为打分函数,用Spark虚拟筛选VeryCommon…
原创文章
小墨
Cresset
2021-04-25
4,770
0
SPARK案例 | 拜尔发现通过干扰RAS-SOS1相互作用能够阻断RAS激活的SOS1抑制剂
本文叙述了拜尔公司科研人员用SPARK发现高效、选择性的SOS1抑制剂的研究过程:首先用片段筛选与高通量筛选发现了与SO…
小墨
Cresset
2019-06-24
5,490
1
SZMAP | 水分子的稳定化自由能计算及其应用
本文对SZMAP计算的水能量学指标进行了总结,重点介绍了SZMAP稳定化自由能与中性水探针自由能差的概念、区别及其应用。…
原创文章
小墨
OpenEye
2017-06-15
4,767
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2024-07-22
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蛋白质动力学和药物发现——通过主成分分析提升项目开发
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计算大环ALK抑制剂的全局构象张力能
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