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用水的能量学信息重现KRAS<sup>G12D</sup>选择性抑制剂MRTX1133的哌嗪侧链优化过程

用水的能量学信息重现KRAS^G12D选择性抑制剂MRTX1133的哌嗪侧链优化过程

本文演示了如何用SZMAP/GAMEPLAN对KRAS G12D-化合物5B的共晶结构（PDB 7RT4）结合位点进行水…

小墨
OpenEye
2022-05-16
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KRAS<sup>G12C</sup>共价抑制剂MRTX849先导化合物优化过程中的水分子替换

KRAS^G12C共价抑制剂MRTX849先导化合物优化过程中的水分子替换

本文以KRAS共价抑制剂MRTX849的先导化合物优化为例，说明水分子替换策略在先导化合物优化过程中的重要性。与经典的分…

小墨
Cresset
2021-08-30
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片段虚拟筛选发现新的KRAS<sup>G12C</sup>共价抑制剂

片段虚拟筛选发现新的KRAS^G12C共价抑制剂

在本算例中，我们以6TAM的共晶配体为先导化合物，用LigandScout基于结构的方法识别药效团并搜索ZINC双环片段…

原创文章
小墨
AutoT&T 2
2021-06-22
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计算赋能工作流识别全新KRAS<sup>G12C</sup>共价别构抑制剂

计算赋能工作流识别全新KRAS^G12C共价别构抑制剂

本文用Ilib Diverse重现了拜尔公司Mortier等人的计算赋能工作流识别全新KRAS G12C共价抑制剂中的组…

原创文章
小墨
Ligandscout
2021-05-25
2,694
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KRAS抑制剂MRTX849骨架跃迁引入新的相互作用

KRAS抑制剂MRTX849骨架跃迁引入新的相互作用

本文详述了如何以MTRX849系列化合物为起始分子，以docking为打分函数，用Spark虚拟筛选VeryCommon…

原创文章
小墨
Cresset
2021-04-25
3,584
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SPARK案例 | 拜尔发现通过干扰RAS-SOS1相互作用能够阻断RAS激活的SOS1抑制剂

SPARK案例 | 拜尔发现通过干扰RAS-SOS1相互作用能够阻断RAS激活的SOS1抑制剂

本文叙述了拜尔公司科研人员用SPARK发现高效、选择性的SOS1抑制剂的研究过程：首先用片段筛选与高通量筛选发现了与SO…

小墨
Cresset
2019-06-24
4,657
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SZMAP | 水分子的稳定化自由能计算及其应用

SZMAP | 水分子的稳定化自由能计算及其应用

本文对SZMAP计算的水能量学指标进行了总结，重点介绍了SZMAP稳定化自由能与中性水探针自由能差的概念、区别及其应用。…

原创文章
小墨
OpenEye
2017-06-15
3,649
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