3D-RISM

使用Flare™水分析3D-RISM在大环抑制剂BRD-810结合位点进行探索、准备与药物设计

本文演示了如何利用Flare水分析工具3D-RISM用来分析大环抑制剂BRD-810与靶标的共晶结构、理解大环的结合模式 ...

原创文章

膜蛋白的自由能微扰计算——用Flare FEP精确地计算暴露于脂质与GPCR P2Y1界面上配体的结合亲合力

本案例研究展示了如何用Flare™ FEP1精确计算结合于P2Y1脂质和GPCR界面之间30个配体的结合亲和力。 ...

联合使用3D-RISM与GIST计算密闭结合位点里水的热力学性质

在本文中，我们提出了一种新的结合位点水热力学性质计算方法，也就是使用基于XED力场的3D-RISM来放置初始的水分子位置 ...

了解水在蛋白-配体复合物中的作用以及在药物发现中何时需要考虑水

Cresset不仅提供药物设计软件，而且有专门的团队提供药物发现服务。 ...

将静电与水的分析作为基于结构设计的核心

Flare的蛋白相互作用势和配体场是理解配体-蛋白相互作用静电特性的有力方法。 ...

借助重要的水加速基于结构的ATX抑制剂先导化合物优化

比利时生物制药公司Galapagos针对自分泌运动因子(Autotaxin， ATX)开发的First-in-class ...

比较BTK抑制剂的配体与蛋白静电势

本文用Flare内置的蛋白相互作用势分析方法来计算BTK激酶活性位点里精细的静电特征。 ...

FLARE教程 | 3D-RISM预测水分子的位置与稳定性

3D-RISM可以用来预测结合位点里水分子的位置与稳定性：哪个水分子是紧密结合地、哪个水分子在能量上是不利，为结构-活性 ...

教程 | SPARK替换结晶水分子

如何利用复合物晶体结构的水分子信息，从一个活性很弱的起始化合物出发，经过片段替换（骨架跃迁、侧链替换）大幅提高化合物的活 ...

基于结构的设计软件Flare测试邀请函

Flare是一款开创性的蛋白-配体分析与设计软件，它整合了当今最尖端的开源与商业技术，为基于结构的设计带来了新视角。 ...

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