Benchmarking

基于结构的过滤提高分子对接虚拟筛选的富集性能

本文以DUD-E的NRAM为子集为例，演示了如何用Flare的相互作用分析对Lead Finder分子对接虚拟筛选结果进 ...

本文以DUD-E PDE5A子集为例，演示了如何用Flare的相互作用分析来对Uni-Dock结果进行基于结构的过滤，在 ...

本文以DUD-E的靶标HIV PR为例，演示了蛋白结构选择对虚拟筛选性能的影响。 ...

本文以DUD-E的EGFR子集为例，在Flare Docking的虚拟筛选模式下对Actives与Decoys进行了分子 ...

本文介绍了基于配体3D相似性计算两种主要方法Tanimoto与Tversky，并将ROCS Tversky相似性方法与文 ...

本文用DUDE+数据集对OEDocking使用单一apo结构的FRED分子对接、单一holo结构的HYBRID分子对接（ ...

本文用DUDE数据集对基于配体的ROCS虚拟筛选方法进行了性能评估，评估指标包括总体性能ROC AUC、早期富集能力lo ...

本文以PDE5A数据集为例，比较了使用单一apo结构的FRED分子对接虚拟筛选与使用多个holo结构的HYBRID分子对 ...

人们已经证明系综虚拟筛选策略可以提高基于配体与基于分子对接虚拟筛选方法的性能，但能否提高基于药效团虚拟筛选方法的性却没有 ...