静态结构的陷阱与水热力学的启示——ATX 抑制剂 GLPG1690 先导化合物优化回溯性研究
自分泌运动因子 (ATX) 抑制剂 GLPG1690 的临床开发虽终止,但其先导化合物优化过程具有重要的方法学借鉴意义。
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FKBP结合位点水合热力学重新审视——Flare GIST与Deep GIST的对比研究
水合热力学在基于结构的药物设计中具有关键作用,准确预测蛋白质结合口袋中水分子的热力学稳定性对配体优化至关重要。
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GIST 结合位点水分析在先导化合物优化中的应用 —— 以 15-PGDH 抑制剂设计为例
水分子在蛋白–配体相互作用中扮演着关键但常被忽视的角色,其中高能水(即热力学不稳定的结合位点水)的置换可显著提升配体结合
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用静电互补性与分子对接打分对ACK1激酶抑制剂铰链结合片段进行优先级排序
本文深入分析了Flare两种轻量级LF VSscore与EC score打分方法对ACK1激酶抑制剂铰链结合片段优先级排
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PDE10A抑制剂MK-8189苗头到先导、先导优化中的水分子置换设计
本文用Flare GIST分析了PDE10A的apo结合位点,用计算的水合位点与水合自由能解释了苗头化物与先导化合物优化
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