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GIST 结合位点水分析在先导化合物优化中的应用 —— 以 15-PGDH 抑制剂设计为例

水分子在蛋白–配体相互作用中扮演着关键但常被忽视的角色，其中高能水（即热力学不稳定的结合位点水）的置换可显著提升配体结合 ...

在本文中，我们利用计算方法重现了新型合成致死药物MRTX1719的基于片段的发现过程。 ...

本文详细介绍了Flare GIST水分析原理，以及如何进行基于GIST的水合位点分析。 ...

本文深入分析了Flare两种轻量级LF VSscore与EC score打分方法对ACK1激酶抑制剂铰链结合片段优先级排 ...

本文用Flare GIST分析了PDE10A的apo结合位点，用计算的水合位点与水合自由能解释了苗头化物与先导化合物优化 ...

在本文中，我们用QPCT/SEN177的共晶结构PDB 6GBX作为QPCTL/SEN177结合模型的代理，回溯性地重现 ...

本文用Flare的QM计算与GIST水能量学计算分析了Parp1抑制剂HRS1167大环化设计。 ...

本文以田野义小分子NNMT抑制剂的发现为例，联合使用Flare与Spark采用分而治之的策略重现了田野义从肽到小分子的发 ...

在基于结构的药物设计中，人们通常对配体进行优化以取代蛋白质结合口袋中能量不利的水分子。 ...

在本文中，我们提出了一种新的结合位点水热力学性质计算方法，也就是使用基于XED力场的3D-RISM来放置初始的水分子位置 ...