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25.10.23
模拟结晶缓冲液中硫酸根介导的氢键网络:一种提升补体因子B抑制剂活性的结构导向策略
25.10.19
计算方法用于配体-蛋白质相互作用排序和结合亲和力预测——哪种方法适合您?
25.10.17
用FieldTemplater预测ROS1抑制剂的生物活性构象
25.09.30
在线会议 | 自由能微扰(FEP)研究——识别“新型”TYK2配体
25.09.27
在缺乏靶标结构信息的情况下解析多种DPPIV配体的结合模式
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二甲基膦酰基衍生物的细胞膜渗透性
文章讨论了二甲基膦酰基衍生物在药物化学中的细胞膜渗透性。膦酰基作为电子吸引基团,因其相对不亲脂的特性而受到关注。 ...
原创文章
噁拉戈利(Elagolix)阻转异构体的QM扭转角分析
本文介绍了阻转异构体的概念,并以抗痛经药物噁拉戈利(Elagolix)为例,演示了如何用Flare QM对模型分子进行扭 ...
分子内硫-孤对电子相互作用
本文以一对结构仅一个原子差异但活性有65倍差异的Factor Xa抑制剂为例,分别用GNINA分子对接与Flare QM ...
用QM构象张力能来对多样的生物等排体母核进行优先级排序
本文介绍一个基于Flare QM的工作流来对不同母核化合物进行构象张力能计算,包括下面步骤:对化合物进行穷尽构象搜索、在 ...
QM扭转角分析——控制依鲁替尼芳香轴构象提高靶标选择性
在本文中,我们用Flare QM对Ibrutinib及其构象控制的衍生物进行了QM扭转角分析,绘制扭转角-激酶活性图。 ...
用扭转角分析解释完美的结合模式、实测活性令人失望的现象
本文用一对结合构象稳定、结合模式一致、分子对接打分区分不开活性的BAZ2A/B抑制剂5、7为例,模拟了结合模式完美、打分 ...
在基于结构的设计中用QM扭转角分析研究构象效应
GSK的Senger等人结合结构生物学与量子化学计算方法,确认了一对仅一个价键差异的分子,其20多倍的生物活性差异是由构 ...
锁定生物活性构象增强活性
本文以HNE抑制剂为例来演示如何用Flare QM的Torsion Profile来评估化合物构象能偏好,复现了从化合物 ...
通过扭转角分析发现先导化合物优化的机会
本文演示了如何用Flare QM的扭转角分析以发现高能的生物学构象并由此发现化合物优化的机会。 ...
从构象稳定性与水分子替换角度理解PARP1抑制剂HRS1167的设计
本文用Flare的QM计算与GIST水能量学计算分析了Parp1抑制剂HRS1167大环化设计。 ...
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查寻分子的准备对基于形状虚拟筛选的影响
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