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文章标签 "Water"
QPCTL抑制剂SEN177的骨架跃迁及结合模式探讨
在本文中,我们用QPCT/SEN177的共晶结构PDB 6GBX作为QPCTL/SEN177结合模型的代理,用GIST方…
原创文章
小墨
Cresset
2024-02-03
1,056
0
从构象稳定性与水分子替换角度理解PARP1抑制剂HRS1167的设计
本文用Flare的QM计算与GIST水能量学计算分析了Parp1抑制剂HRS1167大环化设计。HRS1167的大环设计…
原创文章
小墨
Cresset
2023-11-23
496
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Flare™V7.0发布——增强的分子对接、更好的QSAR建模与更精确的FEP与MD结果
Flare是Cresset基于配体和基于结构的建模平台,本文介绍了最新版本V7全新的、增强的科学和方法,包括用大正则非平…
原创文章
小墨
Cresset
2023-05-15
1,312
0
将水与静电分析作为基于结构设计的核心——BCL6与TYK2 JH2抑制剂算例
本文介绍了两个将水与静电分析作为基于结构设计核心的应用案例。一个算例来自TYK2 JH2抑制剂,GamePlan的取代假…
原创文章
小墨
OpenEye
2022-12-29
1,913
1
配体设计中水分子的计算探索
在基于结构的药物设计中,人们通常对配体进行优化以取代蛋白质结合口袋中能量不利的水分子。另一方面,焓有利的水分子可以被视为…
原创文章
小墨
Flare
2022-09-17
1,477
1
联合使用3D-RISM与GIST计算密闭结合位点里水的热力学性质
在本文中,我们提出了一种新的结合位点水热力学性质计算方法,也就是使用基于XED力场的3D-RISM来放置初始的水分子位置…
原创文章
小墨
Cresset
2022-07-18
2,018
1
计算服务案例 | 用虚拟筛选识别有前途的癫痫抑制剂
Cresset的药物发现服务拥有20多年的历史,具有非常丰富的行业经验和可靠的业绩记录。我们的CADD科学家可以与您一起…
原创文章
小墨
Cresset
2022-07-10
2,444
0
Flare V6发布——新特性、新功能与改进
本文介绍了Flare V6增强的功能和新特性,包括增强的可视化功能、基于反应的组合库枚举、量子力学 (QM)计算、结合口…
小墨
Cresset
2022-07-06
1,891
1
用水的能量学信息重现KRAS
G12D
选择性抑制剂MRTX1133的哌嗪侧链优化过程
本文演示了如何用SZMAP/GAMEPLAN对KRAS G12D-化合物5B的共晶结构(PDB 7RT4)结合位点进行水…
小墨
OpenEye
2022-05-16
3,347
0
了解水在蛋白-配体复合物中的作用以及在药物发现中何时需要考虑水
Cresset不仅提供药物设计软件,而且有专门的团队提供药物发现服务。Cresset在提供药物发现项目方面拥有20年的历…
小墨
Cresset
2022-02-19
1,840
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虚拟筛选——从CB1结合剂中筛选出对CB2具有选择性的先导化合物
2024-04-10
避免虚拟筛选时的化学类型偏好——用3D静电场与形状描述符来探索多样的化学空间
2024-04-03
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