摘要:《第一届大湾区生物物理与新药发现论坛: 学术与企业对话》将于2021年4月10日-4月12日在珠海举办,本次会议旨在架起学术与企业的桥梁,将基础研究成果转化企业研发的动力。会议主题包括:创新生物测活技术、前沿冷冻电镜技术、新药研发新方向、生物计算、人工智能、企业-学术圆桌会议等。本次会议也将为相关领域的人员提供新药研发的新思路和新方法。墨灵格与深圳云端期待与您借机相聚珠海,为您介绍、演示我们的云计算加速药物设计方案。
关于会议
主办方:珠海先进技术研究院、中科院深圳先进技术研究院
协办方:阿尔法分子科技有限责任公司、瑞士巴塞尔大区经济和创新促进局
组委会:袁曙光、 Horst Vogel、徐阳、袁丽娟、陈铭颖、赖奕呈
珠海先进技术研究院、中科院深圳先进技术研究院联合阿尔法分子科技有限责任公司以及瑞士巴塞尔大区经济和创新促进局,于2021年4月10日-4月12日举办“第一届大湾区生物物理与新药发现论坛: 学术与企业对话”。出席本次会议的有:中国科学院院士饶子和、瑞士科学院院士Horst Vogel、新西兰科学院院士Peter Lobie、国家新药筛选中心主任王明伟、中科院深圳先进技术研究院计算药物中心主任(阿尔法分子 CEO)袁曙光、德国默克创新中心副总监莫凌霄、上药集团中央研究院副院长夏广新、百济神州药化总监刘华庆、浙江大学侯廷军教授等。感谢他们百忙之中参加本次会议。
随着创新生物技术与人工智能在生物医药产业的作用日趋重要,如何将最新前沿技术从基础研究引入到当前新药研发中以加速管线进程,已经成为医药产业所面临的重要问题。本次会议旨在架起学术与企业的桥梁,将基础研究成果转化企业研发的动力。会议报告主题内容包括:创新生物测活技术、前沿冷冻电镜技术、新药研发新方向、生物计算、人工智能、企业-学术圆桌会议等。在我们的共同努力下,本次会议也将为相关领域的人员提供新药研发的新思路和新方法。
会议主题
- 创新生物测活技术
- 前沿冷冻电镜技术
- 新药研发新方向
- 人工智能在新药研发中的应用
- 学术成果转化
- 学术-企业圆桌对话
更详细会议信息
地址:珠海市高新区唐家湾镇金唐路港湾1号科创园(唐邑酒店)
请访问会议官网:http://meeting2021.cadd2drug.org/
期待与您在珠海相聚
深圳云端软件有限公司(Cloudam)与广州市墨灵格信息科技有限公司(Molcalx)一直携手为您提供云计算加速药物发现与优化的方案,包括云计算加速药效团虚拟筛选、分子对接虚拟筛选、基于配体与基于结构的基团替换、FEP结合自由能计算以及分子动力学模拟等等。本次会议期间,我们在现场为您介绍并演示我们的云计算方案。
- SPARK:生物等排体替换
- Flare/FEP: 预测相对结合自由能
- Ligandscout:药效团模拟与虚拟筛选
- 基于结构的超大规模数据库虚拟筛选
SPARK是一款生物等排体替换软件,可以进行骨架跃迁、分子生长、分子连接、水分子替换以及大环分子设计等生物等排体替换的分子设计软件。SPARK支持基于配体与基于结构的两种工作模式。其中基于结构的方法需要采用内置的分子对接工具进行计算,尤其对几百万或更多的化合物片段进行虚拟筛选时需要非常大量的计算资源,此时使用云计算加速该过程就想得特别重要。更多SPARK的介绍,请参考博文:SPARK介绍及案例。
自由能微扰(Free Energy Perturbation,FEP)计算可用来预测同系物的相对结合亲和力变化。 在FEP计算中,分子通过非物理(“炼金术”)途径逐渐转变为结构上密切相关的类似物。通过对这些互相转化的终态之间的自由能差(ΔΔG)的计算评估,可以获得与实验值相比约1kcal/mol的预测精度。
Flare/FEP采用GPU来加速计算。在FEP计算时的每个λ窗口都可以独立的用一张GPU来进行计算,有多少个λ窗口就可采用多少张GPU来同步计算而缩短计算时间。云计算可以提供海量的GPU资源以帮助您在1-2小时内完成一个项目,而不是好几天。
更多的关于云计算如何加速FEP计算,请参见我们的博文:云计算加速炼金术法FEP预测结合自由能
Ligandscout是一款用户非常友好的药效团识别与虚拟筛选软件,通过云计算的加速,您可以在几小时甚至几分钟内完成大规模化合物数据库的虚拟筛选,体验药物设计的高效。更多介绍见:云计算教程|LigandScout 使用云计算资源加速药效团虚拟筛选
我们在云端已经部署了基于开源软件Virtualflow的分子对接虚拟筛选系统,您可以快速、便利地完成对Real数据库14亿化合物的分子对接虚拟筛选,更多的介绍请参考我们的博文:在云端用VirtualFlow实现超高通量虚拟筛选