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骨架跃迁”重现”TYK2 JH2抑制剂NDI-034858的发现
本文以BMS公开的6o化合物为起点,经SPARK进行骨架跃迁、Hit Expander的快速结构修饰,再进一步通过简单结 ...
在基于结构的设计中用Flare Viewer来提高视觉分析的效率
很多重要的非经典相互作用不能被传统的分子对接、分子力场等计算方法正确评估,因此视觉分析在基于结构的药物设计中是非常必要且 ...
基于结构药物发现中的决策:对接结果的手工检查
分子对接是一种广泛应用于药物发现的计算方法。 ...
不同寻常的蛋白配体相互作用-PDB可视化算例
本文试图为Kuhn 等人(2019)总结的蛋白-配体相互作用模式提供PDB算例,并用基于结构的软件Flare Viewe ...
数据库挖掘的启示:不同寻常的蛋白-配体相互作用有多重要?
我们提出了一种新方法,可以从PDB的挖掘中获得蛋白-配体原子对的相互作用倾向。 ...
FLARE V3特性预告:新技术与性能提升
本文预告了Flare V3的部分新功能与性能改进。 ...
Ligandscout教程 | 基于片段的虚拟筛选联用AutoT&T进行从头设计
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蛋白结构的检查与准备
从PDB数据库下载的蛋白结构并不完美,正确准备与否影响了分子对接的结果。 ...
SZMAP | 水分子的稳定化自由能计算及其应用
本文对SZMAP计算的水能量学指标进行了总结,重点介绍了SZMAP稳定化自由能与中性水探针自由能差的概念、区别及其应用。 ...
基于结构的设计软件Flare测试邀请函
Flare是一款开创性的蛋白-配体分析与设计软件,它整合了当今最尖端的开源与商业技术,为基于结构的设计带来了新视角。 ...
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