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25.12.16
静电互补性分析:一种高效替代FEP的配体优化策略——以MALT1别构抑制剂为例
25.12.14
通过高效的计算机辅助设计与优先级排序加速 METTL3 抑制剂的发现
25.12.12
Flare™ AI助手最佳实践
25.12.12
Flare™ V11 正式发布:新增生成式 AI 工具、约束的蛋白质-蛋白质对接功能、分离计算模式以及众多其他增强功能
25.12.03
提升QSAR模型的性能——在Flare™中利用稳健的梯度提升机器学习模型应对描述符间的相关性问题
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分子内硫-孤对电子相互作用
本文以一对结构仅一个原子差异但活性有65倍差异的Factor Xa抑制剂为例,分别用GNINA分子对接与Flare QM ...
配体熵很难但不应被忽略
如果采取适当的措施,对接预测的结合模式和亲和力是可以精确计算的。 ...
用QM构象张力能来对多样的生物等排体母核进行优先级排序
本文介绍一个基于Flare QM的工作流来对不同母核化合物进行构象张力能计算,包括下面步骤:对化合物进行穷尽构象搜索、在 ...
QM扭转角分析——控制依鲁替尼芳香轴构象提高靶标选择性
在本文中,我们用Flare QM对Ibrutinib及其构象控制的衍生物进行了QM扭转角分析,绘制扭转角-激酶活性图。 ...
用扭转角分析解释完美的结合模式、实测活性令人失望的现象
本文用一对结合构象稳定、结合模式一致、分子对接打分区分不开活性的BAZ2A/B抑制剂5、7为例,模拟了结合模式完美、打分 ...
在基于结构的设计中用QM扭转角分析研究构象效应
GSK的Senger等人结合结构生物学与量子化学计算方法,确认了一对仅一个价键差异的分子,其20多倍的生物活性差异是由构 ...
锁定生物活性构象增强活性
本文以HNE抑制剂为例来演示如何用Flare QM的Torsion Profile来评估化合物构象能偏好,复现了从化合物 ...
从构象稳定性与水分子替换角度理解PARP1抑制剂HRS1167的设计
本文用Flare的QM计算与GIST水能量学计算分析了Parp1抑制剂HRS1167大环化设计。 ...
用张力能评估构象稳定性及其在先导化合物优化中的应用——更多力场选择
本文用两对化学结构仅一个原子差异但活性相差巨大的分子对为例,尝试用FreeForm以不同的力场计算张力能来解释活性差异的 ...
文献重现 | 大环EGFR激酶抑制剂BI-4020的先导化合物5与6的发现与设计
本文重现了Boehringer Ingelheim的科学家在设计大环EGFR激酶抑制剂BI-4020时先导化合物5与6发 ...
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