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25.09.27
在缺乏靶标结构信息的情况下解析多种DPPIV配体的结合模式
25.09.13
FEP与3D-QSAR相结合的主动学习范式分析
25.08.31
在线会议 | 人工智能重塑药物发现
25.08.31
2025年的FEP:我们需要一个更大的药物发现工具箱
25.08.22
为何人工智能无法挽救那失败的90%临床试验
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分子内硫-孤对电子相互作用
本文以一对结构仅一个原子差异但活性有65倍差异的Factor Xa抑制剂为例,分别用GNINA分子对接与Flare QM ...
配体熵很难但不应被忽略
如果采取适当的措施,对接预测的结合模式和亲和力是可以精确计算的。 ...
用QM构象张力能来对多样的生物等排体母核进行优先级排序
本文介绍一个基于Flare QM的工作流来对不同母核化合物进行构象张力能计算,包括下面步骤:对化合物进行穷尽构象搜索、在 ...
QM扭转角分析——控制依鲁替尼芳香轴构象提高靶标选择性
在本文中,我们用Flare QM对Ibrutinib及其构象控制的衍生物进行了QM扭转角分析,绘制扭转角-激酶活性图。 ...
用扭转角分析解释完美的结合模式、实测活性令人失望的现象
本文用一对结合构象稳定、结合模式一致、分子对接打分区分不开活性的BAZ2A/B抑制剂5、7为例,模拟了结合模式完美、打分 ...
在基于结构的设计中用QM扭转角分析研究构象效应
GSK的Senger等人结合结构生物学与量子化学计算方法,确认了一对仅一个价键差异的分子,其20多倍的生物活性差异是由构 ...
锁定生物活性构象增强活性
本文以HNE抑制剂为例来演示如何用Flare QM的Torsion Profile来评估化合物构象能偏好,复现了从化合物 ...
从构象稳定性与水分子替换角度理解PARP1抑制剂HRS1167的设计
本文用Flare的QM计算与GIST水能量学计算分析了Parp1抑制剂HRS1167大环化设计。 ...
用张力能评估构象稳定性及其在先导化合物优化中的应用——更多力场选择
本文用两对化学结构仅一个原子差异但活性相差巨大的分子对为例,尝试用FreeForm以不同的力场计算张力能来解释活性差异的 ...
文献重现 | 大环EGFR激酶抑制剂BI-4020的先导化合物5与6的发现与设计
本文重现了Boehringer Ingelheim的科学家在设计大环EGFR激酶抑制剂BI-4020时先导化合物5与6发 ...
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基于 Orb V3 神经网络势的分子构象优化与扭转能分析:方法评估与应用拓展
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超越已知领域,发现新型苗头化合物——借助ROCS X搜索万亿级分子
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