Structure-based design

PDE10A抑制剂MK-8189苗头到先导、先导优化中的水分子置换设计

本文用Flare GIST分析了PDE10A的apo结合位点，用计算的水合位点与水合自由能解释了苗头化物与先导化合物优化 ...

本文从激酶特性结合子口袋分析、相互作用分析与生物活性构象稳定性分析等三个角度考察了CT7001对CDK7与CDK2激酶选 ...

本文试图为Kuhn 等人（2019）总结的蛋白-配体相互作用模式提供PDB算例，并用基于结构的软件Flare Viewe ...

罗氏的科学家们分享了一系列小分子药物发现案例，在这些案例中计算方法前瞻性地影响了罗氏的研究项目，目的是凸显那些能够实际带 ...

细菌DNA促旋酶是一种新型抗菌药的靶标，为了发现全新的抑制剂，作者采用了两步设计策略：（1）使用LigandScout分 ...

本文演示了如何将Ligandscout的基于片段虚拟筛选与AutoT&T 2联合使用，实现化合物的从头设计。 ...

Flare V2是Flare的最新版本，一款开创性的基于结构的药物设计软件。 ...

从PDB数据库下载的蛋白结构并不完美，正确准备与否影响了分子对接的结果。 ...

Flare是一款开创性的蛋白-配体分析与设计软件，它整合了当今最尖端的开源与商业技术，为基于结构的设计带来了新视角。 ...

在本研究中，以PBDbind数据库(2014版)的2002个蛋白-配体复合物结构作为测试用数据集，评估了10个分子对接软 ...