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在线会议 | 计算结合于磷脂/膜界面P2Y1 GPCR配体的结合亲和力
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自由能微扰(FEP)方法适用于您的项目吗?
22.10.28
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数据驱动的微扰网络生成用于相对结合自由能计算
在本文中,Mark为大家解释了FEP计算相对结合自由能的原理,总结了爱丁堡大学Scheen和Michel文章关于AI生成…
原创文章
小墨
Cresset
2022-10-28
2,281
2
在线研讨会(视频回放) | 在FEP结合自由能计算中自动确定最优λ规划
本视频介绍了Flare自动确定FEP计算最佳λ的新方法。通过预计算获得相空间重叠矩阵可以发现λ值相距太远而无法良好收敛的…
小墨
Cresset
2022-05-11
1,122
0
云E课堂(12月8日)|云计算加速炼金术法FEP预测结合自由能
本次直播将重点介绍Flare/FEP的特性,并以14个IC50跨度为1000倍的FXR激动剂为例,演示了如何使用Clou…
原创文章
小墨
会议与活动
2020-12-03
1,726
1
FLARE算例 | 炼金术法FEP预测FXR激动剂的结合自由能
本文以D3R CG2的Free Energy Set 2数据集的14个IC50跨度为1000倍的FXR激动剂为例,分析了…
原创文章
小墨
Cresset
2020-07-27
4,053
2
云计算教程 | 用FLARE FEP计算相对结合自由能
已经有大量的算例表明,Flare FEP可以可靠地预测化合物的结合亲和力。本文演示了如何借助Cloudam云E算力平台j…
原创文章
小墨
Cresset
2020-07-17
4,209
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OpenEye案例 | 用FreeForm改善MM/PBSA计算结合自由能
在本研究中,作者用MM/PBSA方法预测配体的EcR结合活性。首先 使用40个已知EcR配体的验证研究表明,当引入配体的…
原创文章
小墨
OpenEye
2019-06-05
4,519
0
FLARE案例 | WaterSwap计算BRD4抑制剂的结合自由能
本文以几个结构多样的BRD4抑制剂为例,展示了FLARE的WaterSwap模块预测结合自由能的性能。结果表明,Wate…
原创文章
小墨
Cresset
2018-04-15
6,729
1
Flare教程 | WaterSwap-如何整合公有云加速结合自由能的计算
本文以Flare的WaterSwap计算结合自由能为例,介绍如何利用云计算资源解决突发性大规模的计算需求,内容包括:1)…
原创文章
小墨
Cresset
2018-02-14
4,507
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FLARE教程 | WaterSwap计算结合自由能
WaterSwap是基于结构设计软件Flare的一个计算模块,专门用来计算配体-蛋白的结合自由能,它可以:1)研究配体结…
原创文章
小墨
Cresset
2017-07-09
8,093
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用扭转角分析解释完美的结合模式、实测活性令人失望的现象
本文用一对结合构象稳定、结合模式一致、分子对接打分区分不开活性的BAZ2A/B抑制剂5、7为例,模拟了结合模式完美、打分…
原创文章
小墨
Cresset
2024-03-13
186
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QM扭转角分析——控制依鲁替尼芳香轴构象提高靶标选择性
基于配体的虚拟筛选发现高亲和力淀粉样蛋白配体
2024-03-09
用QSAR模型对新设计的分子进行优先级排序——SARS-CoV-2 M
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在基于结构的设计中用QM扭转角分析研究构象效应
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锁定生物活性构象增强活性
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