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22.10.28
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基于结构的过滤提高分子对接虚拟筛选的富集性能
本文以DUD-E的NRAM为子集为例,演示了如何用Flare的相互作用分析对Lead Finder分子对接虚拟筛选结果进…
原创文章
小墨
Benchmarking
2023-10-12
1,002
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用基于结构的过滤提高分子对接虚拟筛选的效率
本文以DUD-E PDE5A子集为例,演示了如何用Flare的相互作用分析来对Uni-Dock结果进行基于结构的过滤,在…
原创文章
小墨
Benchmarking
2023-09-24
1,859
0
用数据融合增强分子对接的虚拟筛选性能
本文以DUD-E的EGFR子集为例,在Flare Docking的虚拟筛选模式下对Actives与Decoys进行了分子…
原创文章
小墨
Benchmarking
2023-08-31
1,296
0
Flare™V7.0发布——增强的分子对接、更好的QSAR建模与更精确的FEP与MD结果
Flare是Cresset基于配体和基于结构的建模平台,本文介绍了最新版本V7全新的、增强的科学和方法,包括用大正则非平…
原创文章
小墨
Cresset
2023-05-15
1,199
0
用分子动力学模拟生成蛋白构象系综以用于生物学更加合理的分子对接实验
在本月初的网络研讨会上,我们展示了Flare中的分子动力学模拟和对接如何作为一种先进的研究技术而协同工作。在传统的对接模…
原创文章
小墨
Cresset
2023-04-23
1,549
0
用多个蛋白信息来提高用单一蛋白结构分子对接虚拟筛选的性能
本文以PDE5A数据集为例,比较了使用单一apo结构的FRED分子对接虚拟筛选与使用多个holo结构的HYBRID分子对…
小墨
Benchmarking
2022-03-02
2,583
1
分子对接后处理——与指定残基发生特定相互作用配体的过滤
分子对接后处理可以提高分子对接虚拟筛选的性能。本文分享了如何用Flare的Python API来实现可视化分析的自动化处…
小墨
Cresset
2021-11-02
6,390
0
关于分子对接预测结合模式的问题
本文以Imatinib、dasatinib与ABL1激酶复合物结合模式为例,解释为什么分子对接并不是一件容易的事。
原创文章
小墨
Docking
2021-07-30
5,159
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基于药效团、分子对接、分子形状的深度增强学习结构生成案例汇总
深度生成模型已用来进行从头分子设计,能够生成性质理想的化合物。然而,大部分深度生成模型的性质并不包含比如形状、药效团以及…
原创文章
小墨
案例
2021-07-21
2,776
0
SPARK V10.6发布:新增分子对接功能与改进搜索算法
Spark V10.6是骨架跃迁和生物等排体替换工具SPARK的最新版。它赋能药物化学家和计算化学家们在药物发现项目中使…
原创文章
小墨
Cresset
2021-01-23
1,776
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用扭转角分析解释完美的结合模式、实测活性令人失望的现象
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基于配体的虚拟筛选发现高亲和力淀粉样蛋白配体
2024-03-09
用QSAR模型对新设计的分子进行优先级排序——SARS-CoV-2 M
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抑制剂的2D与3D-QSAR研究
2024-03-07
在基于结构的设计中用QM扭转角分析研究构象效应
2024-03-03
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